南京诸臣皆认为国家不可一日无君，议立新帝，朱由崧显然是最合适的选择。
可是这个时候，大明朝中党派争端再次显示出了惊人的实力，钱谦益等东林党人由于之前的“国本之争”而心存芥蒂，唯恐朱由崧即位后追究昔日东林党人攻讦郑贵妃(朱由崧祖母)之事，故而以立贤为名，拥立穆宗朱载垕第四子朱翊镠之子潞王朱常淓。
朱翊镠与神宗同母，都是生母孝定太后李氏。隆庆四年，仅两岁的朱翊镠受封潞王。
此后，其居京师20年，受尽恩宠。史载，神宗皇帝对自己的这个弟弟颇为宠信，曾赐其田地万顷。万历十七年，已经22岁的朱翊镠就藩卫辉府。在藩二十六年。
万历四十二年孝定太后薨，丧报传到卫辉，朱翊镠悲痛不已，不久亦死，年47，谥号“简”。
其死后，崇祯十七年二月二日，闯军刘芳亮攻占怀庆府，随即卫辉，潞王府危在旦夕时，二月十九日。
朱常涝与福王朱由崧一同逃往淮安。此外，南京兵部尚书史可法则主张既要立贤也要立亲，于是拥立神宗七子桂王朱常瀛。
这位王爷最初封衡州，于天启七年九月二十六就藩。崇祯