宋应星作为要重点招揽的人才，被送到了衡州，李自成原本有意让他直接做衡州府的学官，但大部分人都反对。宋应星本是个教谕而已，按规矩投降之后应该授九品官。虽然闯军也越级提拔了一些人，比如说江西清江县有个叫巩恒的典史，因为名声特好，在闯军破城之前因为在一个案子中刚正不阿，被知县陷害，所以在闯军占领清江后从未入流的小官直接提拔成当地知县，七品正堂，但也只是连升三级而已。
宋应星此人名声不显，就算真有大才，连升五级变成五品学官也太过分了。于是李自成就改授他七品教谕，送到了广州来。到广东没多久，又升了他一级，成了自然科的学正。