就在朱由榔回衡州奔丧之际，远在吕宋的田嘉义和施琅正面临一场与西班牙人的海战。
施琅率领海军陆战队在南洋以战代练，经过清剿海盗、攻打帝力、欧库西等战事，不仅增加了水师新兵的实际作战经验，还影响了南洋的局势，让永明公司在南洋以及印度地区的影响力越来越大。
进入五月，施琅给刘进喜留下一个团的水师陆战队以及10艘巡洋舰、4艘运兵船，安排好训练任务之后带着艘战舰、运兵船、补给船等总计45艘舰船前往吕宋。
刘进喜在南洋负责水师已经三年了，崇祯十三年五月，朱由榔离开马六甲时只给他留下总计20艘各类巡洋舰，到施琅这次到来之前，他麾下的巡洋舰已经达到48艘，另外还有6艘运兵船。
之前刘进喜的主要任务是为永明公司的商船护航，为此他将麾下的舰船分成9组，其中一组拥有战舰8艘外加运兵船6艘，用来巡防和机动作战；其余8组每组拥有巡洋舰5艘，为商船队护航。
如今施琅又留下了这么多舰船外加一个团的水师陆战队，他完全可以在南洋海域称王称霸了，但施琅和朱桦交给他的任务却是练兵、航线测绘、清剿海盗。
永明公司的商船现在的活动范围很大，但往来最多的就是永明岛到马六甲这条航线，途径吕宋、马辰。
在这条航线航行的永明公司的舰船一般都是满载排水量超过2000吨的大舰船，包括万吨大铁船、五千吨大铁船和从荷兰东印度公司购买并改造过的盖伦帆船、笛型船和大肚船。这些商船每艘船都配备不少于10门小钢炮和50条燧发枪，新式铁船上还有舰炮，而且每次航行编组都超过10艘船，也就是说一组船队自己的武装力量就超过100门小钢炮和500条枪，战力强大。
除了这条航线之外，永明公司还有永明岛、济州岛、朝鲜、倭国航线；虎门、大奥、永明岛航线；虎门、大奥、安南、占城、高棉、暹罗航线；马六甲到印度航线等等。
北方航线商船活动主要由永明岛上的战船护航，特别是永明岛经济州岛到朝鲜、倭国的航线，每次商船航行都由8艘以上巡洋舰护航，这是因为郑芝龙的舰船主要在这一带活动，永明公司一直没有放松对郑家的警惕，尽管两家一直有着不错的合作。
施琅的船队这次路过比通，为这个新开辟的补给据点输送了一个团的生产兵以及各类物资。
比通就是后世印尼的比通港，位于米纳哈萨半岛东岸，西距万鸦老约50公里；外有伦贝岛屏蔽，伦贝岛外即马鲁古海峡。
二月份的时候，永明公司协助渤泥国攻打万鸦老，占领了整个米纳哈萨半岛，而永明公司只要了面临马鲁古海峡一侧的包括比通港在内的狭长的大约1800平方公里滨海地域，还有附近的岛屿。
永明公司占据这里并不是为了这里的土地、矿产，更不是为了香料，而是为了航线。
这条航线主要是为了沟通永明岛到明南大陆东海岸。
从大员到吕宋的博龙岸，再到比通，然后依次是龙旺（今印尼法克法克）、龙盛（今印尼马老奇）、南江夏（今澳洲凯恩斯）、南长安（今布里斯班）、南汉城（今悉尼），最后到纡怀州（墨尔本）。
龙旺、龙盛两个港口也和比通同时建设。
施琅带着船队四月廿一离开比通前往博龙岸，途中经过岛屿随机选择进行登陆训练，并安排人进行航海图测绘。
六月十七，施琅带着船队正在今菲律宾利昂阿湾进行训练，却接到田嘉义的电报：有西班牙舰队来袭，希望得到支援。
施琅很纳闷，这西班牙舰队来袭？时隔这么长时间竟然还派舰队来报复？
不怪施琅惊讶，要知道朱由榔亲率大军攻占吕宋已经快四年了。
施琅马上发电报给田嘉义询问详细情况。
西班牙人抽风吗？
还真不是。
朱由榔占据吕宋，并没有释放战俘，只是宿务守军100多人得到消息后匆忙驾船逃走，可是这些人并不熟悉航线，但上天似乎很眷顾这些人，历经10个多月，磕磕绊绊地终于在1640年9月回到了墨西哥城，可惜只剩下47人。
新西班牙总督帕莱福得知下辖的菲律宾被明人占领，尽管暴跳如雷但也无可奈何。
为何？
西班牙作为最早进行殖民的国家之一，在1526年，其领土面积达1024万平方公里，成了一个“日不落强国”。一时之间，无人能望其项背，一跃成为欧洲首屈一指的强国，其通过殖民掠夺所积累的财富同样数不胜数。
然而到了1596年，欠了巨额债务的西班牙政府宣布破产。1598年菲利普二世死时，其所遗留下来的债务高达一亿金币。
之后，西班牙人并没有止住衰落的脚步，欧洲三十年战争爆发（1618--1648年），更是让西班牙加快了衰败的进程。
发生在1639年的唐斯海战，西班牙海军实力再次大损，为了迅速恢复海军实力，西班牙国王下令向新西班牙总督区和秘鲁总督区增加税赋并向本土派送战舰。
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