因为有适合坚守的地利，1937年底杭州沦陷后，浙江省政府及附属机关迁至丽水地区，浙江的不少学校也纷纷迁入，像浙江大学就在其中的龙泉县设立了分校，直至抗战胜利。
当时的丽水是全省抗战的政治、经济、军事中心，1939年4月，周恩来就曾以国民政府军事委员会政治部副部长的身份来丽水视察。
丽水还拥有一座军用机场，是中国东南沿海地区重要的空军基地。
正因如此，依山傍水的丽水城成了日军攻击的目标。
据原中共浙江省委党史研究室编著的《日军侵略浙江罪行史》记载，丽水是浙江全省遭遇日机轰炸最为严重的地区之一，据不完全统计，8年间丽水各县共被炸450多次，其中的丽水县(今市区所在地)被炸365次。
1942年6月至8月，1944年8月至9月，日军两次攻占丽水县县城。其间，日军烧杀淫掠，罪行罄竹难书。
丽水两次沦陷，均与美军在太平洋上的攻势有关。
1942年，日本本土遭到了美军杜立特航空队的空袭，因担心美军利用华东的多个机场再袭日本，日军发起了浙赣战役，进犯丽水是一次配合作战。
1944年，日军在太平洋战场上一败再败，导致日本本土与南洋日军的海上交通线中断。
为此，日军在豫湘桂战场发起了“一号作战”，企图打通中国大陆到中南半岛的大陆交通线，而进犯丽水、温州也是一次配合作战。
两次沦陷中，丽水不但经历了枪林弹雨，还流行了恶疫。
日本关东军731部队、“华中派遣军”的“荣”字1644部队等细菌战部队在当地实施了严重违反国际公法的细菌战，鼠疫、炭疽、伤寒等恶疫肆虐横行。
《侵华日军细菌战在丽水(1942-1944)》封面上的那张战报图片，就来自日本“中国派遣军”司令部作战参谋井本熊男的作战日志。
这部日志直到1993年才被日本学者发现。在第9卷，井本记下了1940年9月18日关东军参谋山本吉郎对细菌战的说明：
“广泛使用稀释dàn • yào 和少次数散布浓度大的情况下，后者选定温州为目标(台州、温州、丽水)……”
而日军对丽水实施细菌战的时间还要更早，至少可以追溯到1940年，当地疫情一直延续到抗战胜利之后，新中国成立之前。
据丽水市侵华日军细菌战受害者史料研究会调查，从1942年至1947年，仅丽水县(现丽水市主城区莲都区)鼠疫伤亡人数就有1926人。而在丽水全市，细菌战的受害者至少有1.5万人。
“我家里有5人感染鼠疫，祖母、姑母、伯母、表兄和堂兄，只有我姑母被伯祖父治愈。”
《侵华日军细菌战在丽水(1942-1944)》的主编、丽水市莲都区丽光村村民庄启俭告诉记者：
“我小时候去上坟，父亲经常和我说起那段历史。”
庄启俭的伯祖父庄虞卿曾考中秀才，曾长期在宁波、杭州、上海行医，并曾在上海的医科大学任教。
“1945年春天，我堂兄庄启兴死于鼠疫。1946年8月29日，奶奶庄戴氏在房间里纳鞋底，突然有只老鼠从脚边跑过，随后又发现自己大腿上被跳蚤叮了一个包，不久就高烧不退。
伯公诊断是鼠疫，先给奶奶服用中药，又用血清针剂注射，但是第二天傍晚，奶奶还是去世了。我大姑母赶来探病，也被传染，还好幸运地被伯公医好了。”
“我家当时住在丽水城中心的太平坊，那里有个‘老人角’。20世纪80年代，老人们在那里谈天说地，都会说起日本人如何凶恶，也会说当时流行的鼠疫是日本人搞的。“”所以我1997年在义乌经商的时候，听说当地成立了日军细菌战中国受害者诉讼原告团，就马上想到了丽水的情况。”
1997年，庄启俭在街上遇到了在当地外事部门工作的初中同学徐军龙。徐军龙告诉他，将有一批日本友好人士前来调查日军细菌战史实。
庄启俭自告奋勇地参加了前期的史料调查工作。
“我记得第一站是去联城镇白前村。当地有位老人叫占炳亮，已经84岁了，曾经在当地的白善小学担任校长。“”1940年秋天开学后不久，学校里暴发疫情，学校老师吕有同的两个儿子同时病倒，1周后双双去世。去买第一口棺材的人还没有到店里，后面的人又赶上来了，说还要再买一口……”
时至今日，庄启俭还记得那对苦命小兄弟的小小坟头，墓碑上还有“朝俊朝林(民国)廿九年秋立”的字样。
“老占和我说，两兄弟的父亲没过多久就回老家缙云壶镇去了，后来也没有回来过。”
1997年12月25日，日本民间和平组织“日军细菌战历史问题揭露会”一行8人来到丽水，庄启俭以受害者家属和调查者的身份参加了座谈，并提供了调查资料。
同时，“侵华日军细菌战丽水受害者协会”开始筹建。
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